Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms