Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LRIT1Q9P2V4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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