Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms