Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20BQ9P0W2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms