Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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