Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCIQ9NVI1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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