Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms