Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms