Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MEPEQ9NQ76 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms