Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms