Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF12Q99081 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms