Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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