Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms