Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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