Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms