Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PRAC1Q96KF2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms