Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC41A2Q96JW4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms