Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms