Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms