Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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