Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELQQ8TDG4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELQQ8TDG4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELQQ8TDG4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELQQ8TDG4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms