Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF439Q8NDP4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms