Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms