Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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LINC00299Q6ZSB3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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LINC00299Q6ZSB3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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LINC00299Q6ZSB3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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LINC00299Q6ZSB3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LINC00299Q6ZSB3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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