Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms