Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms