Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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