Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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