Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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