Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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