Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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