Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms