Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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