Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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