Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms