Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM2Q13029 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM2Q13029 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM2Q13029 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PRDM2Q13029 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
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