Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TWF1Q12792 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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