Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms