Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms