Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms