Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms