Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms