Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms