Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NDUFB6-201ENST00000350021 666 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC112187.3-201ENST00000607844 408 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CEBPZOS-201ENST00000392061 695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC009800.1-201ENST00000511357 1006 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 EMSY-217ENST00000533988 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC134407.1-201ENST00000577385 709 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms