Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms