Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms