Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRP54P61011 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRP54P61011 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRP54P61011 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRP54P61011 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRP54P61011 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRP54P61011 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRP54P61011 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRP54P61011 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms