Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARPC4P59998 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms