Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HK3P52790 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HK3P52790 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms