Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms